自来水对「物理性」和「生物性」污染有办法，但却无法处理「化学性」、「重金属」等污染,例如水源地有农药、杀虫剂、合成洗涤剂、重金属、无机有机化合物等污染。同时，老、旧水管及长期不清洗的水塔，会造成自来水二次污染(带有藻类、红虫、细菌等)。因此，若您老是靠肾脏来充当自来水「净水器」，您可能需要随时准备洗肾。自来水煮开，能挥发掉三卤甲烷，但如「三卤乙酸」等致突变性有机物却不能除去；用铝或铁器煮水时，水中的「亚硝酸氨」会增加；水烧开后，水中含氧量会急剧下降，不利人体「新陈代谢」；综上，建议不要喝自来水，不管是生水还是开水。